物語
度重なるネウロイの進行を阻んできた連合軍第501統合戦闘航空団、通称「STRIKE　WITCHES」
新人である宮藤芳佳は一人前になるべく今日も訓練に明け暮れていた。
そんな最中、ブリタニア本国より最新の模擬戦闘シミュレータが送られてくる。
気をよくした教官、坂本美緒は早速芳佳にシミュレータを使った訓練を命じるのであった。

目指すは撃墜王（エース）、わたし飛びますっ！